Погуглите и Вы найдете информацию о том, что дает данная опция. Прежде всего, возможность регистрации юридических лиц. Вроде там появится возможность прятать цены для каких-то групп и т.п. возможности. Но все они не в явном виде лежат, а в процессе обращения к этим функциям/разделам сайта, как я понял.
Поэтому включайте опцию и попробуйте пройти все стадии - от регистрации и оформления заказа до изменения свойств товара или групп пользователей. Если что интересное заметите, сообщите здесь.
Я тоже пытался сделать один сайт для розничных и оптовых покупателей. Все предложения сводились к: а) вводу разных групп с разными скидками б) мультишопу - 1 магазин для розничных, второй для оптовиков.
Возможно режим B2B - то, что надо. Еще не пробовал - Ваше мнение будет интересно.