Перед созданием каждой таблицы в скрипте есть строка типа "DROP TABLE IF EXISTS `#__...`;". Выполнение этой команды удалит имеющуяся таблицу.данные есть.
придется и суффиксы в таблицах менять — "не Айс!"
импорт, по моему, не заменит существующие таблицы, а выдаст ошибку, или придется сначала эти таблицы удалить, что тоже приведет к потере данных.
слишком сложно все это.