Так там же все просто!
Находим в дизайне шаблон categories.tpl. Смотрим и внимательно втыкаем. Видим что там foreach для всех категорией (записанных в $categories). Для отображения категорий он вызвает еще раз сам себя но с параметром "categories=$c->subcategories". Там еще и условие есть на отображение итерации. Так что думай. Подсказал бы еще что, но к сожалениею не могу понять чего надо. Так что если непонятно то пиши развернутые вопросы.
В коде отметил места куда смотреть.
Код:
{if $categories}
<ul class="catalog_menu">
{foreach item=c from=$categories}
[B]{if $category->category_id != $c->category_id}[/B]
<li tooltip='category' category_id='{$c->category_id}'><a href='catalog/{$c->url}'>{$c->name}</a></li>
{else}
<li tooltip='category' category_id='{$c->category_id}'>{$c->name}</li>
{/if}
[B]{include file=categories.tpl categories=$c->subcategories} [/B]
{/foreach}
</ul>
{/if}