как могут быть проблемы если я настраиваю так как и настраивал,можно подробнее - я крон выносил в .sh из /etc/crontabПервый раз крон всегда запускаете в командной строке. И смотрите что он напишет. При правильной работе крона из командной строки увидите распаковку геобазы и парочку mysql запросов.
Если этого нет - у вас проблемы.
В некоторых случаях я крон выносил в .sh из /etc/crontab , помогало.