Если вы откроете договор который использует яндекс касса, то сейчас там стоит что они не агент, а "оператор" который оказывает услуги по приему денег , вот скрин пункта договора яндекса: Для просмотра ссылки ВойдиВы заблуждаетесь. Яндекс мани - платежная система, а вот Яндекс.Касса это всеж агент. Этот агент так же как и рбк берет комиссию.
слово агент там вообще нигде не присутствует, а значит обязательства выдавать чеки ложится на продавца. А вот скрин (вариант для ИП) "договора присоединения, Для просмотра ссылки Войди