Это для любого стартапа - даже для частного лица
Регистрация в 3 года подразумевает, что доступ к MSDN будет в течение 3 лет, а после, работоспособность и обновление всего софта сохраняется, даже если устанавливаете ПО по истечении 3 лет (можно сохранить ключей на будущее и использовать без ограничений), а результатов разработки ПО с вас никто не потребует.
Главное формальное ограничение, нельзя зарабатывать деньги напрямую с использованием полученного ПО, например, нельзя организовать хостинг на полученной винде или MSSQL.
В общем, кому как, а мне такой вариант предпочтительнее