Не обязательно выбирать конкретный город! Можно выбрать область в которой расположен город. Но данный способ не рекомендуется. Также сам Яндекс Вам в помощь: "Если у Вас сайт общей тематики и не имеет явной региональной принадлежности, то нет необходимости в присвоении ему региона. Это может ухудшить его ранжирование в некоторых регионах."Хорошо, а кто подскажет, как действовать, если работаешь в нескольких регионах?
Например Киев, Харьков, Одесса?
Или Москва, Питер, Саранск?
Правда все равно в выдачу влезут жирные московские сайты, которые продвигаются всюду