написать собственную систему обновления надо - и всего-то.
Я делал сборку по крону лог-информации о версиях модулей, отправлял на центральный хост. В ответ получал архив и перезаписывал файлеги, сделав бэкап.
Хотя, надежнее, все-таки именно инсталляция модуля в связку в базе - ибо бэкапы не приходится делать =)