Стояла подобная задача.
Перепробовал кучу прог, остановился на этой - "SBReplacer"
Предельно небольшая - 20 КБ, очень быстрая, нет проблем с кодировкой, можно выбирать файлы для замены по шаблону.
Еще понравилась в работе "SEARCH+REPLACE" - много полезных настроек, но она платная, правда это не проблема - лекарства есть.
В блокноте, конечно можно заменить автозаменой, НО в рамках одного файла, а здесь количество файлов не ограничено.