Кодировка
Посмотрите, в какой кодировке ваша база в ПХПМайадмине, и в какой кодировке она туда ЗАЛИВАЕТСЯ. Это принципиально, к примеру, ваша база в сп1251, а заливается она в Админы последних версий ПО УМОЛЧАНИЮ в UTF-8. В этом иногда состоит корень проблемы. Это нетрудно учесть... Кодировку можно поправить в дампе, просто поиском найти все места в файле дампа, где она указана. Здесь на форуме есть, где используемая кодировка правится в файлах движка.
Если у вас пошли "вопросики", то перезалить дамп необходимо, попробуйте поиграть с кодировками.
Если у вас после переустановки что-то не отображается вообще, значит, возникли проблемы с правами на файлы. Перепроверьте их, это нудно, но решает проблему. Может, у хостера немного другая система прав - такое бывает. Проконсультируйтесь с ним, или почитайте мануал у него на сайте.
Что касается больших баз, то здесь проблемы неизбежны, я вот тоже не знаю, что в таких случаях делать, потому-что и соединение через шелл тоже может отрубиться, если слишком велик файл. Говорят, БД как-то делится на части...