кладешь в каждую папку доступ к которой хочешь закрыть .htaccess с текстом:
если чисто ко всем папкам сайта то:
если по именам файлов или расширениям:
Код:
<FilesMatch ".(имя_файла1|имя_файла2|расширение1|расширение2)$">
з.ы. очень странно что с таким количеством сообщений ты этого не знаешь, тем более не погуглил даже