Абсолютно вычистить все следы от WP у вас вряд ли получится, потому как знающие люди все равно смогут найти какие-то следы, но кое-что сделать можно:
Так например, можно изменить расположение папки wp-content или вообще переименовать ее:
define( 'WP_CONTENT_DIR', $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . '/blog/wp-content' );
define( 'WP_CONTENT_URL', 'http://example/blog/wp-content');
А вот так можно поменять папку где лежат плагины:
define( 'WP_PLUGIN_DIR', $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . '/blog/wp-content/plugins' );
define( 'WP_PLUGIN_URL', 'http://example/blog/wp-content/plugins');
define( 'PLUGINDIR', $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . '/blog/wp-content/plugins' );
Вот этим плагином например можно изменить ссылку авторизации в блоге:
Вот этим плагином можно удалить строку с версией Wordpress из html кода:
Ну собственно спрашивайте что еще нужно удалить/скрыть, попробую найти